Συνολικά θα πάρουν μέρος στο νέο πρωτάθλημα 132 ομάδες. Σύμφωνα με πληροφορίες της mikriliga.com ο καταρτισμός των ομίλων αναμένεται να πραγματοποιηθεί τέλη Αυγούστου σε σχετική συνεδρίαση της αρμόδιας επιτροπής της ΕΠΟ, ενώ τα γκρουπ που θα χωριστούν οι ομάδες θα είναι 9.
Η ΕΠΟ έχει επίσης το δικαίωμα βάσει προκήρυξης να χωρίσει τις ομάδες που είναι στις Ενώσεις Αθήνας, Πειραιά και Μακεδονίας (εξαιρείται η ΕΠΣ Ηρακλείου, διότι ανήκει στον όμιλο της Κρήτης) καθώς υπερβαίνουν τις 4.
Αναλυτικά οι ομάδες ανά ΕΠΣ με κάθε επιφύλαξη:
ΕΠΣ Αθηνών: Φωστήρας, ΑΕ Κηφισιάς, Άγιος Ιερόθεος, Χαραυγιακός, ΠΑΟ Ρουφ, ΓΣ Ηλιούπολης (6)
ΕΠΣ Αιτωλοακαρνανίας: ΑΕ Μεσολογγίου, Ναυπακτιακός Αστέρας, Αμβρακικός Λουτρού (3)
ΕΠΣ Ανατολικής Αττικής: ΓΣ Μαρκό, Αήττητος Σπάτων, Θύελλα Ραφήνας, Αστέρας Βάρης (4)
ΕΠΣ Αργολίδας: Ναύπλιο 2017, ΑΕ Ερμιονίδας, Κορωνίδα Κοιλάδας (3)
ΕΠΣ Αρκαδίας: Παναρκαδικός, Ερμής Μελιγούς (2)
ΕΠΣ Άρτας: Αναγέννηση Άρτας (1)
ΕΠΣ Αχαΐας: Θύελλα Πατρών, Διαγόρας Βραχνεΐκων, Παναιγιάλειος, Αχαϊκή (4)
ΕΠΣ Βοιωτίας: ΑΟ Υπάτου, Αμβρυσσέας Διστόμου (2)
ΕΠΣ Γρεβενών: Αστέρας Καληράχης (1)
ΕΠΣ Δράμας: Πανδραμαϊκός, ΑΕ Αμπελοκήπων (2)
ΕΠΣ Δυτικής Αττικής: Ακράτητος, Πανελευσινιακός (2)
ΕΠΣ Δωδεκανήσου: Δίας ΑΕ Πυλίου Κω (1)
ΕΠΣ Έβρου: Αλεξανδρούπολη FC, ΑΕ Διδυμότειχου (2)
ΕΠΣ Εύβοιας: Νέα Αρτάκη, Ηρακλής Ψαχνών (2)
ΕΠΣ Ευρυτανίας: ΑΠΟΚ Βελούχι (1)
ΕΠΣ Ζακύνθου: ΑΠΣ Ζάκυνθος, ΑΟ Τσιλιβή, Εθνικός Σκουλικάδου (3)
ΕΠΣ Ηλείας: ΠΑΟ Βάρδας, Αίας Γαστούνης (2)
ΕΠΣ Ημαθίας: Μέγας Αλέξανδρος Τρικάλων, Νίκη Αγκαθιάς, ΠΑΟΚ Αλεξάνδρειας (3)
ΕΠΣ Ηπείρου: Θύελλα Κατσικάς (1)
ΕΠΣ Ηρακλείου: Γιούχτας, Ηρόδοτος, Ατσαλένιος, ΑΟ Πόρου, ΑΟ Δαμάστα, Αλμυρός Γαζίου (6)
ΕΠΣ Θεσπρωτίας: Σούλι Παραμυθιάς (1)
ΕΠΣ Θεσσαλίας: ΓΣ Αλμυρού, Θησέας Αγριάς, Διαγόρας Στεφανοβικείου, Δήμητρα Ευξεινούπολης (4)
ΕΠΣ Θράκης: Δόξα Νέου Σιδηροχωρίου (1)
ΕΠΣ Καβάλας: Νέστος Χρυσούπολης, Αετός Οφρυνίου, Νέος Μέγας Αλέξανδρος Ορφανίου (3)
ΕΠΣ Καρδίτσας: ΑΟ Σελλάνων, Ατρόμητος Παλαμά, Αναγέννηση Καρδίτσας (3)
ΕΠΣ Καστοριάς: Μέγας Αλέξανδρος Καλλιθέας (1)
ΕΠΣ Κέρκυρας: ΑΕ Λευκίμμης, ΟΦ Αγίου Ματθαίου (ΟΦΑΜ) (2)
ΕΠΣ Κεφαλληνίας/Ιθάκης: Παλληξουριακός (1)
ΕΠΣ Κιλκίς: Αναγέννηση Πλαγιάς (1)
ΕΠΣ Κοζάνης: Μακεδονικός Φούφα, ΦΣ Κοζάνη (2)
ΕΠΣ Κορινθίας: Ατρόμητος Χιλιομοδίου (1)
ΕΠΣ Κυκλάδων: ΑΣ Σαντορίνη 2020, Άνω Μερά (συγχώνευση με ΑΕ Μυκόνου), Πανναξιακός (3)
ΕΠΣ Λακωνίας: ΠΣ “H Σπάρτη”, Πανγυθεατικός, Άρης Σκάλας (3)
ΕΠΣ Λάρισας: Οικονόμος Τσαριτσάνης, Ηρακλής Λάρισας, Αετός Μακρυχωρίου, ΠΟ Ελασσόνας (4)
ΕΠΣ Λασιθίου: ΑΟ Αγίου Νικολάου, ΑΕ Νεάπολης, Αναγέννηση Ιεράπετρας (3)
ΕΠΣ Λέσβου: Αιολικός, Αετός Λουτρών (2)
ΕΠΣ Μακεδονίας: Αγροτικός Αστέρας, Ποσειδών Μηχανιώνας, Μακεδονικός, Θερμαϊκός Θέρμης, Εθνικός Σoχού, ΠΑΟ Κουφαλίων, ΑΕ Ευόσμου (7)
ΕΠΣ Μεσσηνίας: ΑΟ Διαβολιτσίου, Πάμισος Μεσσήνης (2)
ΕΠΣ Ξάνθης: Άρης Αβάτου, Ορφέας Ξάνθης, Αναγέννηση Θαλασσιάς (3)
ΕΠΣ Πειραιά: ΑΕ Μοσχάτου, Εθνικός, ΑΠΟ Κερατσίνι, Προοδευτική, Αίας Σαλαμίνας, ΑΟ Καραβάς (6)
ΕΠΣ Πέλλας: Εδεσσαϊκός, Αναγέννηση Γιαννιτσών, Θύελλα Σαρακηνών, Εθνικός Γιαννιτσών (4)
ΕΠΣ Πιερίας: ΑΕ Καρίτσας, Δίας Δίου, Εθνικός Νέου Κεραμιδίου (3)
ΕΠΣ Πρέβεζας / Λευκάδας: Τηλυκράτης Λευκάδας, ΠΑΣ Αχέρων Καναλακίου, ΠΑΣ Πρέβεζα, ΠΑΣ Θύελλα 2015 (4)
ΕΠΣ Ρεθύμνου: Ρεθυμνιακός, ΑΟ Νέος Αστέρας Ρεθύμνου, Άρης Περιβολίων Ρεθύμνου (3)
ΕΠΣ Σάμου: ΑΨΕΣ Πυθαγόρας (1)
ΕΠΣ Σερρών: Απόλλων Παραλιμνίου (1)
ΕΠΣ Τρικάλων: ΑΣ Μετέωρα, ΠΟ Φήκης (2)
ΕΠΣ Φθιώτιδας: ΑΠΟ Αταλάντη, Οπούντιος Μαρτίνου (2)
ΕΠΣ Φλώρινας: Ερμής Αμυνταίου (1)
ΕΠΣ Φωκίδας: Φωκικός (1)
ΕΠΣ Χαλκιδικής: ΠΟ Νέας Καλλικράτειας, Αετός Βαρβάρας (2)
ΕΠΣ Χανίων: ΑΕΕΚ ΣΥΝΚΑ, Άρης Σούδας, ΑΟ Παλαιόχωρας (3)
ΕΠΣ Χίου: ΑΠΕ Μικρασιατική (1)
